Los primeros antecedentes de la comuna tienen origen el 9 de julio de 1593 cuando el entonces Gobernador del Reino y Provincias de Chile, Capitán General Mayor y Caballero de la Orden de Calatrava Martín García Óñez de Loyola nombra a Alvaro de Villagra (hijo de Francisco de Villagra), como Corregidor y Alcalde de Minas para varios poblados de la zona en que incluye el poblado de Pichidegua.
La comuna de Pichidegua se creó por Decreto Supremo, de fecha 22 de diciembre de 1891. El nombre se origina en los antepasados nativos, que estarían conformados por elementos étnicos Promaucaes.
Su primer alcalde fue Don Eliseo Garcia Munita y su actual alcalde es Don Ruben Adolfo Cerón Gonzalez.
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